プロトコール

1. 0. 実験室での諸注意および基本事項
   1. 0-1. 諸注意と基本事項
   1. 0-2. ノートの書き方
   1. 0-3. 参考文献の引用について
   1. 0-4. 発表用レジュメについて
   1. 0-5. 微生物実験ガイダンス資料
   1. 0-6. 遺伝子組換え実験ガイダンス資料
   1. 0-7. 卒論・修論目次例
2. 1. 機器の使用法
1. 1-1. 大型機器の使用法
1. 1-2. pH計の使い方
1. 1-3. 無菌操作
1. 1-4. アガロースゲル電気泳動のマーカー
1. 1-5. アガロースゲル電気泳動
1. 1-6. LAS-4000の撮影方法
3. 2. 共通する実験技法
   1. 2-1. LB培地の調整
   1. 2-2. よく使う試薬の調整
   1. 2-3. 制限酵素処理
   1. 2-4. Bacillus属細菌からの全DNA抽出
   1. 2-5. ゲルからのDNAの切り出し
   1. 2-6. 蛍光顕微鏡を用いた細菌数の計数
   1. 2-6-1. 顕微鏡カメラマニュアル
   1. 2-7. PCRによるDNA増幅
   1. 2-8. サザンハイブリダイゼーション
   1. 2-9. ISOILによるDNA回収
   1. 2-10. ISOIL beads beating によるDNA回収
   1. 2-11．リアルタイム定量PCR
   1. 2-12. 16SrDNAのPCR増幅
   1. 2-13. 細菌の群集構造解析 DGGE
   1. 2-13-1. 細菌の群集構造解析 TGGE
   1. 2-14. DGGEデータの解析
   1. 2-15. Eco plateを用いた群集機能解析
   1. 2-16. フィルターに捕集した細菌からプラスミドDNAを抽出する
4. 3. 水銀耐性細菌の実験に関する項目
   1. 3-1. 土壌からの芽胞形成水銀耐性細菌の分離
   1. 3-2. 細菌の水銀耐性能の評価
   1. 3-3. エアフィルターからの芽胞形成水銀耐性細菌の分離
5. 4. 細胞外DNAに関する項目
   1. 4-1. 溶存態DNA(dDNA)の回収法（イソプロパノール沈殿）
   1. 4-1-1. 溶存態DNA(dDNA)の回収法（エタノール沈殿）
   1. 4-2. 溶存態DNA(dDNA)の定量法（Qubit）
   1. 4-2-1. Qubitの取り扱い説明書
6. 5. バイオフィルムに関する項目
   1. 5-1. バイオフィルムの回収
   1. 5-2. バイオフィルムからのDNA抽出
7. 6. マイクロコズム(多様性)実験に関する項目
   1. 6-1. マイクロコズムの作製
   1. 6-2. 溶存酸素量の計測方法
   1. 6-3. マリンブロスの作製
   1. 6-4. バイオログ（エコプレート）の測定
8. 7. 水質分析に関する項目
   1. 7-0. 下水のサンプリング処理
   1. 7-1. 全リンの分析
   1. 7-2. 全窒素の分析
   1. 7-3. クロロフィルaの分析
   1. 7-4. 硝酸態窒素の分析
   1. 7-5. 亜硝酸態窒素の分析
   1. 7-6. CHNコーダーを用いた懸濁態物質の分析
9. 99. 保存株に関する情報
   1. 99-1. MBGD株のリスト
   1. 99-2. Tetrahymena他の保存用培地
   1. 99-3. 藻類・原生生物の植えつぎと保存法
   1. 99-4. 細菌の抗生物質耐性能